Nuestro héroe, el gran príncipe guerrero de Persia, luego de batallas y guerras conquistadas, vuelve a suhogaren tierras de Babilonia, junto a él viene su dama y futura reina, Kaileena la Emperatriz del Tiempo, con las ansias de ser felices, desean reinar con justicia y borrar las cicatrices de cruentas batallas del cruel pasado.

Pero la negra bruma de la hostilidad no se agota, su reino a caído bajo un río de sangre y guerras fantasmales, en pleno camino se ven emboscados por otros enemigos, pese al esfuerzo del príncipe, Kaileena es raptada. Él no conoce la rendición, el filo de su espada tendrá que doblegar a una serie de sanguinarios enemigos, y decidido irá en busca de su querida dama del tiempo.

Sin embargo, el destino le tendrá reservado un trágico momento, al perseguirlos y ya en Palacio, el príncipe es testigo de la muerte de Kaileena amanosde su oscuro enemigo, quedando así liberado el poder de las arenas del tiempo, que al instante se introducen en el cuerpo del joven príncipe, poniendo en peligro con esto, a todo aquello con que sueña.

En su escape, tendrá que librarse de las garras de sus enemigos, y descubre que un nuevo enemigo va contaminando su cuerpo, y dará negra luz al nacimiento del Príncipe Oscuro. Nuestro héroe debe ser enemigo del tiempo y en contra de él buscar la liberación de su alma y la paz en su pueblo.